| Номер | Русское | Латинское | Статус |
|---|
| 623 | Саккориза кожистая | Saccorhiza dermatodea | Сокращающиеся в численности |
| 446 | Ива Гордеева | Salix gordejevii | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 442 | Кровохлебка великолепная | Sanguisorba magnifica | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 653 | Саркосома шаровидная | Sarcosoma globosum | Сокращающиеся в численности |
| 65 | Соссюрея скребницелистная | Saussurea ceterachifolia | Редкие |
| 66 | Соссюрея Дорогостайского | Saussurea dorogostaiskii | Сокращающиеся в численности |
| 67 | Соссюрея Ядринцева | Saussurea jadrinzevii | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 68 | Соссюрея советская | Saussurea sovietica | Редкие |
| 69 | Соссюрея уральская | Saussurea uralensis | Редкие |
| 448 | Камнеломка колончатая | Saxifraga columnaris | Редкие |
| 449 | Камнеломка Динника | Saxifraga dinnikii | Редкие |
| 450 | Камнеломка Коржинского | Saxifraga korshinskii | Редкие |
| 451 | Камнеломка молочная | Saxifraga lactea | Редкие |
| 156 | Скабиоза Ольги | Scabiosa olgae | Редкие |
| 574 | Скапания шариконосная | Scapania sphaerifera | Сокращающиеся в численности |
| 531 | Схистидиум скрытоплодный | Schistidium cryptocarpum | Редкие |
| 245 | Схизофрагма гортензиевидная | Schizophragma hydrangeoides | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 242 | Пролеска пролесковидная | Scilla scilloides | Вероятно исчезнувшие |
| 455 | Норичник меловой | Scrophularia cretacea | Редкие |
| 394 | Рожь Куприянова | Secale kuprijanovii | Сокращающиеся в численности |
| 140 | Очиток щитковый | Sedum corymbosum | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 546 | Зелигерия эландская | Seligeria oelandica | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 362 | Серапиас сошниковый | Serapias vomeracea | Сокращающиеся в численности |
| 70 | Серпуха донская | Serratula tanaitica | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 128 | Смолевка Акинфиева | Silene akinfievii | Редкие |
| 129 | Смолевка меловая | Silene cretacea | Редкие |
| 130 | Смолевка Гельманна | Silene hellmannii | Редкие |
| 131 | Смолевка скальная | Silene rupestris | Сокращающиеся в численности |
| 618 | Сифонокладус крохотный | Siphonocladus pusillus | Сокращающиеся в численности |
| 650 | Сиродотия шведская | Sirodotia suecica | Редкие |
| 106 | Смеловския неожиданная | Smelowskia inopinata | Редкие |
| 443 | Рябинник сумахолистный | Sorbaria rhoifolia | Редкие |
| 444 | Рябинокизильник Позднякова | Sorbocotoneaster pozdnjakovii | Редкие |
| 675 | Спарассис курчавый, | Sparassis crispa | Редкие |
| 547 | Сфагнум мягкий | Sphagnum molle | Сокращающиеся в численности |
| 363 | Скрученник спиральный | Spiranthes spiralis | Редкие |
| 414 | Срединския большая | Sredinskya grandis | Редкие |
| 460 | Клекачка колхидская | Staphylea colchica | Редкие |
| 461 | Клекачка перистая | Staphylea pinnata | Редкие |
| 125 | Звездчатка Мартьянова | Stellaria martjanovii | Редкие |
| 465 | Стеллеропсис алтайский | Stelleropsis altaica | Редкие |
| 466 | Стеллеропсис кавказский | Stelleropsis caucasica | Редкие |
| 71 | Стеммоканта сафлоровидная | Stemmacantha carthamoides | Редкие |
| 610 | Стереокаулон пальчатолистный | Stereocaulon dactylophyllum | Сокращающиеся в численности |
| 611 | Стереокаулон обнаженный | Stereocaulon exutum | Редкие |
| 612 | Стереокаулон хоккайдский | Stereocaulon hokkaidense | Редкие |
| 613 | Стереокаулон ложнодепрельтовский | Stereocaulon pseudodepreaultii | Редкие |
| 614 | Стереокаулон Савича | Stereocaulon saviczii | Редкие |
| 21 | Штернбергия колхикоцветная | Sternbergia colhiciflora | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 107 | Стевения Сергиевской | Stevenia sergievskajae | Сокращающиеся в численности |
| 364 | Стевениелла сатириовидная | Steveniella satyrioides | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 587 | Стикта окаймленная | Sticta limbata | Редкие |
| 621 | Стилофора нежная | Stilophora tenella | Сокращающиеся в численности |
| 395 | Ковыль родственный | Stipa consanguinea | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 396 | Ковыль опушеннолистный | Stipa dasyphylla | Редкие |
| 397 | Ковыль перистый | Stipa pennata | Редкие |
| 398 | Ковыль красивейший | Stipa pulcherrima | Редкие |
| 399 | Ковыль Сырейщикова | Stipa syreistschikowii | Находящиеся под угрозой исчезновения |
| 400 | Ковыль Залесского | Stipa zalesskii | Редкие |
| 666 | Шишкогриб хлопьеножковый | Strobilomyces floccopus | Редкие |
| 643 | Щаповия бичевидная | Stschapovia flagelliformis | Редкие |
| 232 | Сверция байкальская | Swertia baicalensis | Редкие |
| 233 | Сверция многолетняя | Swertia perennis | Находящиеся под угрозой исчезновения |
